En lille dreng gemmer sig under sin seng og tæller sekunderne mellem lynet og tordenen.
1 … 2 … 3 …
Pludselig hører han et kæmpe brag. Men denne gang er det ikke lynet. Der er nogen ude i tordenvejret, som har brug for hans hjælp.
Det er en lille sky. Skyen er blevet væk fra sin familie i uvejret og kan ikke længere flyve. Drengen ved ikke noget om at flyve, men han ved, hvordan det er at miste nogen, man holder af, og beslutter sig for at hjælpe skyen.
Sammen gennemgår de to usædvanlige venner en masse strabadser for at få skyen til at flyve igen, så den kan komme hjem til sin familie.
Skyen der ikke kunne flyve er en fortælling om venskab, savn og mod og egner sig til højtlæsning for børn i alderen 3-9 år.
